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Sommaire

  • 1Le nucléole, centre de production des ribosomes
  • 2Régions organisatrices nucléolaires
  • 3Organisation interne du nucléole
    • 3.1Centre fibrillaire
    • 3.2Composant fibrillaire dense
    • 3.3Composant granulaire
  • 4Transcription des ARN ribosomiques
  • 5Maturation des ARN ribosomiques lock — section verrouillée
  • 6Assemblage des sous-unités ribosomiques lock — section verrouillée
    • 6.1Petite sous-unité lock — section verrouillée
    • 6.2Grande sous-unité lock — section verrouillée
  • 7Dynamique du nucléole au cours du cycle cellulaire lock — section verrouillée
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B4 · Noyau

Nucléole et biogenèse des ribosomes

Décrire l'organisation du nucléole et son lien avec les régions organisatrices nucléolaires. Suivre la transcription, la maturation des ARN ribosomiques et l'assemblage des deux sous-unités du ribosome.

Biologie cellulaire·schedule6 min de lecture·quiz15 QCM corrigés

Le nucléole, centre de production des ribosomes

Définition

Nucléole

Domaine nucléaire non délimité par une membrane, spécialisé dans la transcription et la maturation des ARN ribosomiques ainsi que dans les premières étapes d’assemblage des sous-unités ribosomiques.

Le nucléole est visible comme une région dense du noyau en interphase. Il ne constitue pas un organite permanent et fermé : ses composants s’associent de manière dynamique autour de gènes ribosomiques actifs. Sa formation résulte notamment d’une séparation de phase, c’est-à-dire d’un regroupement local de macromolécules qui se concentrent sans être entourées d’une membrane.

La fonction nucléolaire repose sur trois opérations coordonnées :

  1. transcription des gènes codant les ARN ribosomiques ;
  2. maturation des précurseurs d’ARN ribosomiques ;
  3. association des ARN ribosomiques avec les protéines ribosomiques.

Le transport à travers les pores nucléaires, notamment l’importation des protéines ribosomiques et l’exportation des pré-sous-unités, est détaillé dans la fiche consacrée à l’enveloppe nucléaire et au transport nucléocytoplasmique.

Régions organisatrices nucléolaires

Définition

Région organisatrice nucléolaire

Région chromosomique contenant des répétitions en tandem des gènes codant le précurseur commun des ARN ribosomiques 18S18\mathrm{S}18S, 5,8S5{,}8\mathrm{S}5,8S et 28S28\mathrm{S}28S.

Les régions organisatrices nucléolaires, souvent désignées par le sigle RON, portent de nombreuses copies successives d’une même unité de transcription ribosomique. Cette répétition permet à plusieurs ARN polymérases de transcrire simultanément les gènes ribosomiques, ce qui répond à la forte demande cellulaire en ribosomes.

Chez l’être humain, les RON sont situées sur les bras courts des chromosomes acrocentriques 13, 14, 15, 21 et 22. Toutes les copies d’ADN ribosomique ne sont pas nécessairement actives au même moment. Les régions actives de plusieurs chromosomes se rapprochent dans le noyau et participent à la constitution d’un même nucléole.

Définition

ADN ribosomique

Ensemble des séquences d’ADN répétées qui codent les ARN ribosomiques. Il est abrégé en ADNr.

La taille et le nombre des nucléoles dépendent donc de l’activité transcriptionnelle des gènes ribosomiques. Une cellule produisant intensément des protéines doit renouveler de nombreux ribosomes et possède généralement des nucléoles particulièrement développés.

À retenir

Origine du nucléole

Le nucléole se forme autour des régions organisatrices nucléolaires dont les gènes ribosomiques sont actifs. Il n’est ni entouré d’une membrane ni indépendant des chromosomes.

Organisation interne du nucléole

Le nucléole présente trois compartiments fonctionnels, reconnaissables par leur aspect en microscopie électronique. Leur disposition traduit la succession spatiale des étapes de la biogenèse ribosomique.

Centre fibrillaire

Le centre fibrillaire contient principalement l’ADNr et des facteurs nécessaires à sa transcription. Les gènes ribosomiques actifs se trouvent à sa périphérie, au contact du compartiment fibrillaire dense.

Composant fibrillaire dense

Le composant fibrillaire dense entoure les centres fibrillaires. Il correspond aux régions où apparaissent les transcrits ribosomiques naissants et où commencent leurs modifications et leurs clivages.

Composant granulaire

Le composant granulaire occupe la plus grande partie du nucléole. Il contient les précurseurs ribosomiques en cours d’association avec les protéines ribosomiques. Son aspect granulaire provient de l’accumulation de particules pré-ribosomiques.

Comparaison

Compartiments fonctionnels du nucléole

CompartimentContenu dominantFonction principale
Centre fibrillaireADNr et facteurs de transcriptionorganisation des gènes ribosomiques
Composant fibrillaire densepré-ARNr naissants et facteurs de maturationmaturation précoce des ARN ribosomiques
Composant granulaireARN ribosomiques et protéines ribosomiquesassemblage des particules pré-ribosomiques

Cette organisation n’établit pas des frontières étanches. Les molécules progressent d’un compartiment à l’autre au cours d’un processus continu.

Transcription des ARN ribosomiques

Définition

Pré-ARN ribosomique

Long transcrit primaire qui doit être clivé et modifié pour produire plusieurs ARN ribosomiques matures.

Dans les cellules eucaryotes, l’ARN polymérase I transcrit l’ADNr en un précurseur appelé pré-ARNr 47S. Au cours de sa maturation précoce, celui-ci est aussi désigné comme pré-ARNr 45S. Il contient, dans une même molécule, les séquences destinées à devenir les ARNr 18S18\mathrm{S}18S, 5,8S5{,}8\mathrm{S}5,8S et 28S28\mathrm{S}28S.

Ces séquences matures sont séparées par des régions transcrites éliminées lors de la maturation :

  • les séquences transcrites externes, placées aux extrémités du précurseur ;
  • les séquences transcrites internes, situées entre les futurs ARNr.

L’ARNr 5S5\mathrm{S}5S suit une voie différente. Son gène n’appartient pas à l’unité transcrite par l’ARN polymérase I : il est transcrit dans le nucléoplasme par l’ARN polymérase III, puis rejoint le nucléole pour participer à l’assemblage de la grande sous-unité.

Attention

ARNr 5S et ARN polymérase I

L’ARN polymérase I produit le précurseur des ARNr 18S18\mathrm{S}18S, 5,8S5{,}8\mathrm{S}5,8S et 28S28\mathrm{S}28S, mais pas l’ARNr 5S5\mathrm{S}5S. Celui-ci est transcrit séparément par l’ARN polymérase III.

Maturation des ARN ribosomiques

La maturation du pré-ARNr associe des clivages et des modifications chimiques. Les clivages retirent les séquences transcrites externes et internes, puis séparent les trois ARNr matures. Les modifications stabilisent leur structure et favorisent leurs interactions avec les protéines ainsi qu’avec les ARN de transfert lors de la traduction.

Définition

Petit ARN nucléolaire

Court ARN localisé dans le nucléole qui guide une enzyme vers une séquence déterminée du pré-ARNr afin d’y réaliser une modification ou de participer à son clivage.

Les petits ARN nucléolaires s’associent à des protéines pour former des petites ribonucléoprotéines nucléolaires. Par complémentarité de bases, leur ARN reconnaît une région précise du pré-ARNr. Ils guident notamment :

  • la méthylation du ribose en position 2′2'2′ ;
  • la transformation de certaines uridines en pseudouridines ;
  • certains clivages nécessaires à l’obtention des ARNr matures.
Méthode

Maturation du pré-ARNr

  1. Transcrire l’unité d’ADNr en un long pré-ARNr
  2. Replier le transcrit naissant avec l’aide de protéines et de petits ARN nucléolaires
  3. Modifier chimiquement des nucléotides déterminés
  4. Cliver les séquences transcrites externes et internes
  5. Séparer les ARNr 18S18\mathrm{S}18S, 5,8S5{,}8\mathrm{S}5,8S et 28S28\mathrm{S}28S
  6. Incorporer chaque ARNr dans la pré-sous-unité qui lui correspond

Assemblage des sous-unités ribosomiques

Les protéines ribosomiques sont codées par des gènes transcrits dans le nucléoplasme. Leurs ARN messagers sont exportés vers le cytoplasme, où ils sont traduits. Les protéines produites sont ensuite importées dans le noyau et gagnent le nucléole.

L’association entre les ARNr en maturation, les protéines ribosomiques et de nombreux facteurs transitoires forme d’abord une grande particule pré-ribosomique. Celle-ci se sépare progressivement en deux voies d’assemblage.

Petite sous-unité

La pré-sous-unité 40S40\mathrm{S}40S contient l’ARNr 18S18\mathrm{S}18S associé aux protéines de la petite sous-unité. Après des étapes de maturation et de contrôle, elle est exportée vers le cytoplasme, où sa maturation s’achève.

Grande sous-unité

La pré-sous-unité 60S60\mathrm{S}60S contient les ARNr 28S28\mathrm{S}28S, 5,8S5{,}8\mathrm{S}5,8S et 5S5\mathrm{S}5S associés aux protéines de la grande sous-unité. Elle subit elle aussi des remaniements, des contrôles puis un export séparé vers le cytoplasme.

Formule

Composition du ribosome eucaryote

80S=40S+60S80\mathrm{S} = 40\mathrm{S} + 60\mathrm{S}80S=40S+60S
  • 80S80\mathrm{S}80S : ribosome eucaryote assemblé
  • 40S40\mathrm{S}40S : petite sous-unité ribosomique
  • 60S60\mathrm{S}60S : grande sous-unité ribosomique
  • S\mathrm{S}S : unité de Svedberg, caractérisant la vitesse de sédimentation d’une particule

Les sous-unités ne s’associent en ribosome fonctionnel que dans le cytoplasme, au moment de la traduction d’un ARN messager.

Attention

Les coefficients de Svedberg ne sont pas additifs

40S+60S40\mathrm{S} + 60\mathrm{S}40S+60S donne un ribosome 80S80\mathrm{S}80S et non 100S100\mathrm{S}100S. Le coefficient de sédimentation dépend de la masse, mais aussi de la forme et de la densité de la particule.

Dynamique du nucléole au cours du cycle cellulaire

Au début de la mitose, la transcription de l’ADNr s’interrompt et l’organisation nucléolaire disparaît. Les composants du nucléole se dispersent tandis que les chromosomes se condensent. À la fin de la mitose, la transcription reprend au niveau des RON actives. Les pré-ARNr produits recrutent alors les facteurs de maturation et d’assemblage, ce qui reconstitue progressivement les nucléoles.

Cette disparition puis cette réapparition montrent que le nucléole est une structure fonctionnelle auto-organisée par l’activité des gènes ribosomiques, et non un compartiment transmis comme une structure membranaire préexistante.

Points clés
  • Le nucléole est un domaine nucléaire sans membrane formé autour des régions organisatrices nucléolaires actives.
  • L’ARN polymérase I produit un pré-ARNr donnant les ARNr 18S18\mathrm{S}18S, 5,8S5{,}8\mathrm{S}5,8S et 28S28\mathrm{S}28S.
  • L’ARNr 5S5\mathrm{S}5S est transcrit séparément par l’ARN polymérase III.
  • Les petits ARN nucléolaires guident les modifications et certains clivages du pré-ARNr.
  • La sous-unité 40S40\mathrm{S}40S contient l’ARNr 18S18\mathrm{S}18S, tandis que la sous-unité 60S60\mathrm{S}60S contient les ARNr 28S28\mathrm{S}28S, 5,8S5{,}8\mathrm{S}5,8S et 5S5\mathrm{S}5S.
  • Les pré-sous-unités sont assemblées dans le nucléole puis exportées séparément avant de former le ribosome 80S80\mathrm{S}80S dans le cytoplasme.

Fiches connexes

À réviser dans la foulée, sur Noyau.

  • Fiche 01Enveloppe nucléaire et transport nucléocytoplasmiqueNoyau
  • Fiche 03Chromosomes, caryotype et techniques de cytogénétiqueNoyau
  • Fiche 01Cellule procaryote et cellule eucaryoteOrganisation générale
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