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Sommaire

  • 1Principe de la phosphorylation oxydative
  • 2Théorie chimio-osmotique
  • 3L’ATP synthase
    • 3.1Conversion de la rotation en ATP
  • 4Coût énergétique d’un ATP exporté lock — section verrouillée
  • 5Établir le bilan d’oxydation complète d’un substrat lock — section verrouillée
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B2 · Bioénergétique

Phosphorylation oxydative et théorie chimio-osmotique

Expliquer la conversion du gradient électrochimique de protons en ATP par l'ATP synthase selon la théorie chimio-osmotique. Établir le bilan énergétique de l'oxydation complète d'un substrat.

Biochimie structurale et métabolique·schedule6 min de lecture·quiz15 QCM corrigés

Principe de la phosphorylation oxydative

Définition

Phosphorylation oxydative

Synthèse mitochondriale d'ATP à partir d'ADP et de phosphate inorganique, noté Pi\mathrm{P_i}Pi​, grâce à l'énergie du gradient électrochimique de protons produit par l'oxydation des coenzymes réduits.

La membrane mitochondriale interne sépare la matrice de l'espace intermembranaire. La chaîne respiratoire, étudiée dans la fiche précédente, transfère les électrons du NADH et du FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​ jusqu'à l'oxygène et utilise l'énergie libérée pour expulser des protons H+\mathrm{H^+}H+ hors de la matrice.

La membrane interne étant presque imperméable aux protons, ce transfert établit deux différences entre ses faces :

  • une différence de concentration en protons, donc de pH ;
  • une différence de potentiel électrique, la matrice devenant négative par rapport à l'espace intermembranaire.
Définition

Gradient électrochimique de protons

Différence d'énergie potentielle des protons entre les deux faces de la membrane, résultant à la fois du gradient chimique de concentration et du gradient électrique.

Définition

Force proton-motrice

Énergie électrochimique disponible pour faire revenir les protons vers la matrice. Elle associe la différence de potentiel électrique et la différence de pH.

Formule

Force proton-motrice

Δp=Δψ−2,303RTFΔpH\Delta p = \Delta \psi - \frac{2{,}303RT}{F}\Delta \mathrm{pH}Δp=Δψ−F2,303RT​ΔpH
  • Δp\Delta pΔp : force proton-motrice, exprimée comme une différence de potentiel
  • Δψ\Delta \psiΔψ : potentiel électrique de la matrice relativement à l'espace intermembranaire
  • RRR : constante des gaz parfaits
  • TTT : température absolue
  • FFF : constante de Faraday
  • ΔpH\Delta \mathrm{pH}ΔpH : pH matriciel moins pH de l'espace intermembranaire

La matrice est plus négative et plus alcaline que l'espace intermembranaire. Les composantes électrique et chimique favorisent donc toutes deux le retour des protons dans la matrice.

Théorie chimio-osmotique

Définition

Théorie chimio-osmotique

Modèle selon lequel la chaîne respiratoire et la synthèse d'ATP ne sont pas directement reliées par un intermédiaire chimique : elles sont couplées par un gradient électrochimique de protons à travers la membrane mitochondriale interne.

Le couplage repose sur trois étapes logiques :

  1. l’oxydation du NADH ou du FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​ libère de l’énergie ;
  2. la chaîne respiratoire convertit cette énergie en force proton-motrice ;
  3. le retour des protons par l’ATP synthase convertit la force proton-motrice en énergie chimique de l’ATP.

La membrane interne joue donc un rôle essentiel : si les protons pouvaient la traverser librement, le gradient disparaîtrait et l’oxydation des coenzymes réduits ne pourrait plus entraîner efficacement la synthèse d’ATP.

À retenir

Nature du couplage

Le transfert d’électrons et la synthèse d’ATP sont couplés par la force proton-motrice, et non par une liaison chimique directe entre la chaîne respiratoire et l’ATP synthase.

L’ATP synthase

Définition

ATP synthase

Complexe enzymatique de la membrane mitochondriale interne qui utilise le retour des protons vers la matrice pour catalyser la formation d’ATP à partir d’ADP et de Pi\mathrm{P_i}Pi​.

L’ATP synthase comprend deux secteurs fonctionnels :

  • le secteur Fo\mathrm{F_o}Fo​, inséré dans la membrane, constitue la voie de passage des protons ;
  • le secteur F1\mathrm{F_1}F1​, orienté vers la matrice, porte les sites catalytiques de synthèse de l’ATP.

Le secteur Fo\mathrm{F_o}Fo​ contient notamment une sous-unité aaa et un anneau de sous-unités ccc. Le passage séquentiel des protons provoque la rotation de cet anneau. Celle-ci entraîne la rotation de la tige centrale, principalement constituée par la sous-unité γ\gammaγ, à l’intérieur de la tête catalytique F1\mathrm{F_1}F1​.

Conversion de la rotation en ATP

La tête F1\mathrm{F_1}F1​ comporte trois sous-unités catalytiques β\betaβ. La rotation de la sous-unité γ\gammaγ impose successivement à chacune trois conformations :

  • une conformation lâche, qui fixe l’ADP et le Pi\mathrm{P_i}Pi​ ;
  • une conformation serrée, qui favorise la formation de l’ATP ;
  • une conformation ouverte, qui libère l’ATP.
Méthode

Conversion de la force proton-motrice en ATP

  1. Les protons pénètrent dans le secteur Fo\mathrm{F_o}Fo​ depuis l’espace intermembranaire
  2. Leur fixation puis leur libération font tourner l’anneau de sous-unités ccc
  3. La rotation est transmise à la sous-unité centrale γ\gammaγ
  4. Les sous-unités catalytiques β\betaβ changent successivement de conformation
  5. L’ADP et le Pi\mathrm{P_i}Pi​ sont fixés, convertis en ATP, puis l’ATP est libéré dans la matrice

Une rotation complète de la tige centrale produit trois ATP, car les trois sous-unités β\betaβ accomplissent chacune un cycle catalytique. Le nombre exact de protons requis dépend du nombre de sous-unités constituant l’anneau ccc.

Attention

Énergie et libération de l’ATP

L’énergie mécanique n’est pas seulement utilisée pour former l’ATP. Elle sert surtout à modifier l’affinité des sites catalytiques et à permettre la libération de l’ATP fortement lié.

Coût énergétique d’un ATP exporté

La synthèse d’ATP matriciel exige aussi l’approvisionnement en substrats :

  • l’ADP cytosolique entre dans la matrice en échange d’un ATP matriciel par la translocase des nucléotides adényliques ;
  • le Pi\mathrm{P_i}Pi​ entre avec un proton grâce au transporteur du phosphate ;
  • l’ATP formé doit être exporté vers le cytosol.

Ces transports consomment directement ou indirectement une partie de la force proton-motrice. Pour établir un bilan énergétique global, on retient approximativement un coût de quatre protons par ATP rendu disponible dans le cytosol.

La chaîne respiratoire expulse approximativement :

  • dix protons par paire d’électrons fournie par un NADH mitochondrial ;
  • six protons par paire d’électrons fournie au niveau du coenzyme Q par le FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​.
Définition

Rapport P/O

Nombre moyen d’ATP synthétisés par paire d’électrons transférée jusqu’à un atome d’oxygène, soit une demi-molécule de O2\mathrm{O_2}O2​.

Il en résulte les rendements conventionnels :

  • environ 2,52{,}52,5 ATP par NADH mitochondrial ;
  • environ 1,51{,}51,5 ATP par FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​.
À retenir

Rendements conventionnels

Le calcul énergétique moderne utilise les rapports P/O approximatifs de 2,52{,}52,5 ATP par NADH mitochondrial et de 1,51{,}51,5 ATP par FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​.

Établir le bilan d’oxydation complète d’un substrat

Une oxydation complète transforme les atomes de carbone du substrat en CO2\mathrm{CO_2}CO2​ et transfère les électrons à l’oxygène, réduit en eau. Le bilan doit inclure deux sources d’ATP :

  • la phosphorylation au niveau du substrat, produisant directement de l’ATP ou du GTP ;
  • la phosphorylation oxydative, alimentée par le NADH et le FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​.
Formule

Bilan énergétique général

NATP=Ndirect+2,5NNADH+1,5NFADH2N_{\mathrm{ATP}} = N_{\mathrm{direct}} + 2{,}5N_{\mathrm{NADH}} + 1{,}5N_{\mathrm{FADH_2}}NATP​=Ndirect​+2,5NNADH​+1,5NFADH2​​
  • NATPN_{\mathrm{ATP}}NATP​ : nombre total estimé de molécules d’ATP
  • NdirectN_{\mathrm{direct}}Ndirect​ : nombre d’ATP ou de GTP produits au niveau du substrat
  • NNADHN_{\mathrm{NADH}}NNADH​ : nombre de NADH mitochondriaux réoxydés
  • NFADH2N_{\mathrm{FADH_2}}NFADH2​​ : nombre de FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​ réoxydés
Méthode

Calculer le rendement d’une oxydation complète

  1. Recenser les ATP et GTP formés directement
  2. Compter tous les NADH produits
  3. Distinguer les NADH mitochondriaux des NADH cytosoliques
  4. Compter les FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​ ou les paires d’électrons entrant au niveau du coenzyme Q
  5. Appliquer les rapports P/O correspondants
  6. Additionner la phosphorylation au niveau du substrat et la phosphorylation oxydative

Lors de l’oxydation complète du glucose, les voies métaboliques produisent au total dix NADH, deux FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​ et quatre ATP équivalents par phosphorylation au niveau du substrat. Deux des NADH sont toutefois formés dans le cytosol, alors que la membrane mitochondriale interne ne laisse pas passer directement le NADH.

Leurs électrons sont transférés par une navette :

  • la navette malate-aspartate conserve un rendement équivalent à celui du NADH mitochondrial, donnant un bilan total d’environ 323232 ATP ;
  • la navette du glycérol-3-phosphate transmet les électrons au coenzyme Q avec un rendement équivalent à celui du FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​, donnant environ 303030 ATP.
Exemple

Calcul du bilan énergétique du glucose selon la navette

Pour une molécule de glucose, quatre ATP équivalents sont formés directement. Les huit NADH produits dans la matrice fournissent :

8×2,5=208 \times 2{,}5 = 208×2,5=20 ATP.

Les deux FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​ fournissent :

2×1,5=32 \times 1{,}5 = 32×1,5=3 ATP.

Avec la navette malate-aspartate, les deux NADH cytosoliques conservent le rendement de 2,52{,}52,5 ATP chacun :

2×2,5=52 \times 2{,}5 = 52×2,5=5 ATP.

Le bilan est donc :

4+20+3+5=324 + 20 + 3 + 5 = 324+20+3+5=32 ATP.

Avec la navette du glycérol-3-phosphate, les électrons des deux NADH cytosoliques ont un rendement de 1,51{,}51,5 ATP chacun :

2×1,5=32 \times 1{,}5 = 32×1,5=3 ATP.

Le bilan devient :

4+20+3+3=304 + 20 + 3 + 3 = 304+20+3+3=30 ATP.

La différence de deux ATP provient exclusivement du rendement des deux NADH cytosoliques, déterminé par la navette utilisée.

Attention

Un rendement qui dépend de la navette

Les NADH cytosoliques ne doivent pas être automatiquement comptés à 2,52{,}52,5 ATP. Leur rendement dépend du système utilisé pour transférer leurs électrons vers la chaîne respiratoire.

Comparaison

Deux modes de phosphorylation

CritèrePhosphorylation au niveau du substratPhosphorylation oxydative
Source immédiate d’énergietransfert direct d’un groupement phosphoryleforce proton-motrice
Dépendance envers la membrane internenonoui
Dépendance envers l’ATP synthasenonoui
Contribution quantitative majeurelimitéeprédominante
Points clés
  • La chaîne respiratoire transforme l’énergie d’oxydation en gradient électrochimique de protons
  • La théorie chimio-osmotique fait de la force proton-motrice l’intermédiaire entre respiration et synthèse d’ATP
  • Le retour des protons par Fo\mathrm{F_o}Fo​ entraîne une rotation qui modifie les conformations catalytiques de F1\mathrm{F_1}F1​
  • Les rendements conventionnels sont d’environ 2,52{,}52,5 ATP par NADH mitochondrial et 1,51{,}51,5 ATP par FADH2\mathrm{FADH_2}FADH2​
  • Le bilan total additionne l’ATP formé directement et celui issu de la réoxydation des coenzymes réduits
  • L’oxydation complète du glucose fournit environ 303030 ou 323232 ATP selon la navette des NADH cytosoliques

Fiches connexes

À réviser dans la foulée, sur Bioénergétique.

  • Fiche 01Énergétique cellulaire : couplage, ATP et composés riches en énergieBioénergétique
  • Fiche 02Chaîne respiratoire mitochondrialeBioénergétique
  • Fiche 04Découplants, inhibiteurs et rendement énergétiqueBioénergétique
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  • 1Principe de la phosphorylation oxydative
  • 2Théorie chimio-osmotique
  • 3L’ATP synthase
    • 3.1Conversion de la rotation en ATP
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