B2 · Bioénergétique
Phosphorylation oxydative et théorie chimio-osmotique
Expliquer la conversion du gradient électrochimique de protons en ATP par l'ATP synthase selon la théorie chimio-osmotique. Établir le bilan énergétique de l'oxydation complète d'un substrat.
Biochimie structurale et métabolique6 min de lecture15 QCM corrigés
Principe de la phosphorylation oxydative
La membrane mitochondriale interne sépare la matrice de l'espace intermembranaire. La chaîne respiratoire, étudiée dans la fiche précédente, transfère les électrons du NADH et du jusqu'à l'oxygène et utilise l'énergie libérée pour expulser des protons hors de la matrice.
La membrane interne étant presque imperméable aux protons, ce transfert établit deux différences entre ses faces :
- une différence de concentration en protons, donc de pH ;
- une différence de potentiel électrique, la matrice devenant négative par rapport à l'espace intermembranaire.
La matrice est plus négative et plus alcaline que l'espace intermembranaire. Les composantes électrique et chimique favorisent donc toutes deux le retour des protons dans la matrice.
Théorie chimio-osmotique
Le couplage repose sur trois étapes logiques :
- l’oxydation du NADH ou du libère de l’énergie ;
- la chaîne respiratoire convertit cette énergie en force proton-motrice ;
- le retour des protons par l’ATP synthase convertit la force proton-motrice en énergie chimique de l’ATP.
La membrane interne joue donc un rôle essentiel : si les protons pouvaient la traverser librement, le gradient disparaîtrait et l’oxydation des coenzymes réduits ne pourrait plus entraîner efficacement la synthèse d’ATP.
L’ATP synthase
L’ATP synthase comprend deux secteurs fonctionnels :
- le secteur , inséré dans la membrane, constitue la voie de passage des protons ;
- le secteur , orienté vers la matrice, porte les sites catalytiques de synthèse de l’ATP.
Le secteur contient notamment une sous-unité et un anneau de sous-unités . Le passage séquentiel des protons provoque la rotation de cet anneau. Celle-ci entraîne la rotation de la tige centrale, principalement constituée par la sous-unité , à l’intérieur de la tête catalytique .
Conversion de la rotation en ATP
La tête comporte trois sous-unités catalytiques . La rotation de la sous-unité impose successivement à chacune trois conformations :
- une conformation lâche, qui fixe l’ADP et le ;
- une conformation serrée, qui favorise la formation de l’ATP ;
- une conformation ouverte, qui libère l’ATP.
Une rotation complète de la tige centrale produit trois ATP, car les trois sous-unités accomplissent chacune un cycle catalytique. Le nombre exact de protons requis dépend du nombre de sous-unités constituant l’anneau .
Coût énergétique d’un ATP exporté
La synthèse d’ATP matriciel exige aussi l’approvisionnement en substrats :
- l’ADP cytosolique entre dans la matrice en échange d’un ATP matriciel par la translocase des nucléotides adényliques ;
- le entre avec un proton grâce au transporteur du phosphate ;
- l’ATP formé doit être exporté vers le cytosol.
Ces transports consomment directement ou indirectement une partie de la force proton-motrice. Pour établir un bilan énergétique global, on retient approximativement un coût de quatre protons par ATP rendu disponible dans le cytosol.
La chaîne respiratoire expulse approximativement :
- dix protons par paire d’électrons fournie par un NADH mitochondrial ;
- six protons par paire d’électrons fournie au niveau du coenzyme Q par le .
Il en résulte les rendements conventionnels :
- environ ATP par NADH mitochondrial ;
- environ ATP par .
Établir le bilan d’oxydation complète d’un substrat
Une oxydation complète transforme les atomes de carbone du substrat en et transfère les électrons à l’oxygène, réduit en eau. Le bilan doit inclure deux sources d’ATP :
- la phosphorylation au niveau du substrat, produisant directement de l’ATP ou du GTP ;
- la phosphorylation oxydative, alimentée par le NADH et le .
Lors de l’oxydation complète du glucose, les voies métaboliques produisent au total dix NADH, deux et quatre ATP équivalents par phosphorylation au niveau du substrat. Deux des NADH sont toutefois formés dans le cytosol, alors que la membrane mitochondriale interne ne laisse pas passer directement le NADH.
Leurs électrons sont transférés par une navette :
- la navette malate-aspartate conserve un rendement équivalent à celui du NADH mitochondrial, donnant un bilan total d’environ ATP ;
- la navette du glycérol-3-phosphate transmet les électrons au coenzyme Q avec un rendement équivalent à celui du , donnant environ ATP.
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