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Sommaire

  • 1Structure et classification des amines
  • 2Géométrie de l'azote aminé
  • 3Propriétés basiques
  • 4Propriétés nucléophiles lock — section verrouillée
  • 5Principaux dérivés azotés du vivant lock — section verrouillée
    • 5.1Ions ammonium et ammoniums quaternaires lock — section verrouillée
    • 5.2Imines et énamines lock — section verrouillée
    • 5.3Amides lock — section verrouillée
    • 5.4Amidines et groupements guanidiniques lock — section verrouillée
    • 5.5Hétérocycles azotés lock — section verrouillée
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B1 · Fonctions chimiques du vivant

Amines et dérivés azotés

Classer les amines selon la substitution de l'azote et décrire la géométrie du doublet non liant. Analyser leurs propriétés basiques et nucléophiles et présenter les principaux dérivés azotés rencontrés dans le vivant.

Chimie générale et organique·schedule6 min de lecture·quiz17 QCM corrigés

Structure et classification des amines

Définition

Amine

Composé organique dérivé formellement de l'ammoniac NHX3\ce{NH3}NHX3​ par remplacement d'un, de deux ou de trois atomes d'hydrogène par des groupes carbonés.

On note RRR un groupe carboné organique et H\ce{H}H un atome d'hydrogène. La classe d'une amine dépend du nombre de groupes carbonés directement liés à l'azote, et non du degré de substitution du carbone voisin.

Comparaison

Classification des amines

ClasseFormule généraleSubstitution de l'azote
Amine primaireR−NHX2\ce{R-NH2}R−NHX2​un groupe carboné
Amine secondaireRX2NH\ce{R2NH}RX2​NHdeux groupes carbonés
Amine tertiaireRX3N\ce{R3N}RX3​Ntrois groupes carbonés
Ion ammonium quaternaireRX4NX+\ce{R4N+}RX4​NX+quatre groupes carbonés et charge positive

Une amine peut être aliphatique lorsque l'azote est lié à un carbone non aromatique, ou aromatique lorsqu'il est directement lié à un cycle aromatique. Cette distinction modifie fortement la disponibilité électronique du doublet non liant.

Attention

Classe de l'amine et classe de l'alcool

Pour une amine, on compte les groupes carbonés portés par l'azote. Pour un alcool, la classification repose sur les groupes carbonés portés par le carbone lié à l'oxygène. Les deux conventions ne doivent pas être transposées l'une à l'autre.

L'ion ammonium quaternaire n'est pas une amine au sens strict. Son azote forme quatre liaisons covalentes et ne possède plus de doublet non liant.

Géométrie de l'azote aminé

Dans une amine aliphatique non conjuguée, l'azote établit trois liaisons σ\sigmaσ et porte un doublet non liant. Il est généralement décrit comme hybridé sp3sp^3sp3 : ses quatre domaines électroniques occupent approximativement les sommets d'un tétraèdre.

Définition

Doublet non liant

Paire d'électrons de valence localisée sur un atome et ne participant pas directement à une liaison covalente.

Comme l'un des quatre sommets est occupé par le doublet, la géométrie définie par les trois substituants est une pyramide trigonale. Le doublet repousse plus fortement les doublets liants qu'une liaison ne repousse une autre liaison, ce qui comprime les angles entre les substituants.

L'azote pyramidal peut subir une inversion : les trois substituants traversent un état presque plan, puis la pyramide se reforme de l'autre côté. Cette inversion est généralement rapide. Ainsi, une amine tertiaire portant trois groupes différents n'est habituellement pas isolable sous deux configurations stables, contrairement à un carbone asymétrique.

Inversion de la pyramide autour de l'azote aminé
Inversion de la pyramide autour de l'azote aminé

Lors de la protonation, le doublet forme une nouvelle liaison avec HX+\ce{H+}HX+. L'ion ammonium obtenu possède quatre liaisons et adopte une géométrie approximativement tétraédrique.

Dans une amine conjuguée à un système π\piπ, le doublet peut se délocaliser. L'azote tend alors vers une géométrie plus plane, compatible avec le recouvrement d'une orbitale portant le doublet avec les orbitales voisines.

À retenir

La présence et la disponibilité du doublet non liant expliquent à la fois la basicité et la nucléophilie des amines. Un ammonium quaternaire, dépourvu de doublet, ne possède pas ces propriétés.

Propriétés basiques

Définition

Base de Brønsted

Espèce chimique capable de capter un proton HX+\ce{H+}HX+.

Une amine neutre, notée B\ce{B}B, peut utiliser son doublet pour capter un proton fourni par l'eau. Elle forme alors son acide conjugué, noté BHX+\ce{BH+}BHX+.

B+HX2O⇌BHX++OHX−\ce{B + H2O <=> BH+ + OH-}B+HX2​O​BHX++OHX−

La basicité d'une amine est souvent décrite à partir de l’acidité de son ammonium conjugué.

Formule

Acidité de l'ammonium conjugué

Ka=[B][HX3OX+][BHX+];pKa=−log⁡10(Ka)K_a = \frac{[\ce{B}][\ce{H3O+}]}{[\ce{BH+}]} \qquad ; \qquad pK_a = -\log_{10}(K_a)Ka​=[BHX+][B][HX3​OX+]​;pKa​=−log10​(Ka​)
  • KaK_aKa​ : constante d'acidité de l'ion ammonium conjugué
  • pKapK_apKa​ : cologarithme décimal de KaK_aKa​
  • [B][\ce{B}][B] : concentration de l'amine neutre
  • [HX3OX+][\ce{H3O+}][HX3​OX+] : concentration des ions oxonium
  • [BHX+][\ce{BH+}][BHX+] : concentration de l'ammonium conjugué
  • log⁡10\log_{10}log10​ : logarithme décimal

Plus le pKapK_apKa​ de BHX+\ce{BH+}BHX+ est élevé, moins cet ion cède facilement son proton et plus la base B\ce{B}B correspondante est forte. La relation entre le pH, le pKapK_apKa​ et les proportions des deux formes relève des équilibres acido-basiques étudiés dans la fiche dédiée.

Exemple

Comparer la basicité de la méthylamine et de l'aniline

Les valeurs de pKapK_apKa​ des acides conjugués suivantes sont comparées :

  • méthylammonium, acide conjugué de la méthylamine : pKa=10,6pK_a = 10{,}6pKa​=10,6 ;
  • anilinium, acide conjugué de l'aniline : pKa=4,6pK_a = 4{,}6pKa​=4,6.

L'écart est 10,6−4,6=6,010{,}6 - 4{,}6 = 6{,}010,6−4,6=6,0 unités de pKapK_apKa​.

Le méthylammonium cède moins facilement son proton que l'anilinium, car son pKapK_apKa​ est plus élevé. La méthylamine est donc une base plus forte que l'aniline. La délocalisation du doublet de l'aniline vers le cycle aromatique contribue à rendre ce doublet moins disponible pour la protonation.

Plusieurs effets modulent cette basicité :

  • un groupe carboné donneur d'électrons augmente la densité électronique sur l'azote et tend à renforcer la basicité ;
  • un groupe attracteur d'électrons diminue cette densité et tend à affaiblir la basicité ;
  • la délocalisation du doublet rend celui-ci moins disponible pour fixer un proton ;
  • la solvatation stabilise différemment l'amine et son ammonium conjugué ;
  • l'encombrement stérique peut gêner l'approche du proton ou la stabilisation de l'espèce protonée.

À pH inférieur au pKapK_apKa​ de l'ammonium conjugué, la forme protonée BHX+\ce{BH+}BHX+ prédomine. À pH supérieur, la forme neutre B\ce{B}B prédomine. La protonation augmente généralement la solubilité dans l'eau, car elle crée une espèce chargée fortement hydratée.

Propriétés nucléophiles

Définition

Nucléophile

Espèce riche en électrons capable de fournir un doublet électronique à un centre déficient en électrons afin de former une liaison covalente.

Le doublet de l'azote permet donc à une amine d'attaquer un centre électrophile. Une amine primaire, secondaire ou tertiaire peut être nucléophile tant que son doublet reste accessible. La réaction peut conduire à une nouvelle liaison carbone–azote ou à un dérivé ammonium.

La basicité est une propriété thermodynamique : elle décrit la position d'un équilibre de transfert de proton. La nucléophilie est une propriété cinétique : elle décrit la vitesse d'attaque d'un électrophile. Elles évoluent souvent dans le même sens, car elles dépendent toutes deux du doublet, mais elles ne sont pas équivalentes.

Comparaison

Basicité et nucléophilie

CritèreBasicitéNucléophilie
Centre attaquéproton HX+\ce{H+}HX+centre électrophile
Nature de la propriététhermodynamiquecinétique
Grandeur déterminantestabilité relative des espècesvitesse de réaction
Effet stériquesouvent modéré pour un protonpotentiellement majeur pour un électrophile encombré
Attention

Une amine protonée n'est plus nucléophile sur l'azote

Dans BHX+\ce{BH+}BHX+, le doublet de l'amine a servi à former la liaison avec le proton. L'azote protoné ne peut donc plus fournir ce même doublet à un électrophile.

Principaux dérivés azotés du vivant

Ions ammonium et ammoniums quaternaires

Les ions ammonium résultent de la protonation réversible des amines. Cette transformation dépend du pH et modifie la charge, la solubilité ainsi que les interactions électrostatiques.

Les ammoniums quaternaires portent quatre groupes carbonés sur un azote chargé positivement. Leur charge est permanente et ne dépend pas d'un simple équilibre de protonation.

Imines et énamines

Définition

Imine

Fonction comportant une double liaison carbone–azote, représentée par C=N\ce{C=N}C=N.

Dans une imine, le carbone et l'azote sont approximativement trigonaux plans. L'azote est décrit comme hybridé sp2sp^2sp2 et conserve un doublet dans une orbitale hybridée. Le carbone de la liaison C=N\ce{C=N}C=N est électrophile, tandis que l'azote peut être basique.

Définition

Énamine

Fonction dans laquelle un azote aminé est directement lié à une double liaison carbone–carbone, selon le motif C=C−N\ce{C=C-N}C=C−N.

Le doublet de l'azote est conjugué avec la liaison π\piπ. Cette délocalisation modifie la répartition de la densité électronique et rend le système réactif sur plusieurs atomes.

Amides

Un amide comporte un azote directement lié au carbone d'un groupe carbonyle. Son doublet est fortement délocalisé vers ce carbonyle, ce qui rend l'azote presque plan, beaucoup moins basique et moins nucléophile qu'une amine. La structure et la réactivité détaillées des amides relèvent de la fiche consacrée aux dérivés des acides carboxyliques.

Amidines et groupements guanidiniques

Une amidine associe un carbone lié à deux atomes d'azote, dont l'un participe à une liaison double. Après protonation, la charge positive peut se délocaliser sur plusieurs atomes d'azote, ce qui stabilise fortement l'acide conjugué et explique leur caractère basique.

Un groupement guanidinique étend cette organisation à trois atomes d'azote liés au même carbone. Sa forme protonée est particulièrement stabilisée par résonance.

Délocalisation de la charge dans les ions amidinium et guanidinium
Délocalisation de la charge dans les ions amidinium et guanidinium

Hétérocycles azotés

Définition

Hétérocycle azoté

Cycle organique dont au moins un sommet est occupé par un atome d'azote.

La basicité dépend du rôle du doublet dans l'aromaticité :

  • si le doublet ne participe pas au système aromatique, il reste disponible pour la protonation ;
  • s'il contribue au système aromatique, sa protonation perturberait la délocalisation électronique et la basicité devient beaucoup plus faible.
Disponibilité du doublet dans deux hétérocycles aromatiques
Disponibilité du doublet dans deux hétérocycles aromatiques
À retenir

La disponibilité du doublet dépend de sa localisation, de sa délocalisation par conjugaison, de la charge de l'azote et de l'encombrement. Cette disponibilité commande la géométrie, la basicité et la nucléophilie.

Points clés
  • Une amine primaire, secondaire ou tertiaire porte respectivement un, deux ou trois groupes carbonés sur l'azote.
  • L'azote d'une amine non conjuguée est généralement pyramidal, hybridé sp3sp^3sp3 et porteur d'un doublet non liant.
  • Une amine est basique parce qu'elle peut capter un proton et nucléophile parce qu'elle peut fournir son doublet à un électrophile.
  • Basicité et nucléophilie sont distinctes : la première est thermodynamique, la seconde cinétique.
  • La conjugaison délocalise le doublet et diminue généralement sa disponibilité.
  • Les principales fonctions azotées comprennent les ammoniums, imines, énamines, amides, amidines et hétérocycles azotés.

Fiches connexes

À réviser dans la foulée, sur Fonctions chimiques du vivant.

  • Fiche 01Nomenclature systématique des molécules organiquesFonctions chimiques du vivant
  • Fiche 02Reconnaître les grandes fonctions organiques du vivantFonctions chimiques du vivant
  • Fiche 03Alcanes, alcènes et alcynesFonctions chimiques du vivant
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