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Sommaire

  • 1Finalité et organisation générale
  • 2Phase oxydative
    • 2.1Oxydation du glucose-6-phosphate
    • 2.2Régulation de la G6PD
  • 3Phase non oxydative
    • 3.1Interconversion des pentoses
    • 3.2Réarrangement des squelettes carbonés lock — section verrouillée
  • 4Adaptation aux besoins cellulaires lock — section verrouillée
    • 4.1Besoin conjoint en NADPH et en ribose lock — section verrouillée
    • 4.2Besoin prédominant en ribose-5-phosphate lock — section verrouillée
    • 4.3Besoin prédominant en NADPH lock — section verrouillée
  • 5NADPH, biosynthèses et défense antioxydante lock — section verrouillée
    • 5.1Biosynthèses réductrices lock — section verrouillée
    • 5.2Protection contre le stress oxydant lock — section verrouillée
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B2 · Métabolisme intermédiaire

Voie des pentoses phosphates

Décrire les phases oxydative et non oxydative de la voie des pentoses phosphates et ses deux produits : pouvoir réducteur et ribose. Relier son fonctionnement aux besoins cellulaires en biosynthèses et en défense contre le stress oxydant.

Biochimie structurale et métabolique·schedule7 min de lecture·quiz15 QCM corrigés

Finalité et organisation générale

Définition

Voie des pentoses phosphates

Voie métabolique cytosolique qui transforme le glucose-6-phosphate afin de produire du pouvoir réducteur sous forme de NADPH\mathrm{NADPH}NADPH et des pentoses phosphates, notamment le ribose-5-phosphate.

La voie des pentoses phosphates constitue une voie parallèle au début de la glycolyse. Elle ne vise pas directement la production d'ATP. Son activité répond à deux besoins cellulaires distincts :

  • fournir du NADPH pour les biosynthèses réductrices et la défense antioxydante ;
  • fournir du ribose-5-phosphate pour la synthèse des nucléotides.

Le glucose-6-phosphate est donc un carrefour : il peut être engagé dans la glycolyse, stocké sous forme de glycogène ou dirigé vers la voie des pentoses phosphates. Ces orientations sont détaillées dans les fiches consacrées aux voies glucidiques correspondantes.

Définition

Pouvoir réducteur

Capacité d'une molécule à céder des électrons, généralement sous la forme d'un ion hydrure. Dans cette voie, le pouvoir réducteur est porté par le NADPH\mathrm{NADPH}NADPH.

Définition

Pentose phosphate

Monosaccharide à cinq atomes de carbone portant un groupement phosphate. Le ribose-5-phosphate et le ribulose-5-phosphate appartiennent à cette catégorie.

La voie comporte deux ensembles de réactions :

  1. une phase oxydative, irréversible, qui produit du NADPH\mathrm{NADPH}NADPH ;
  2. une phase non oxydative, réversible, qui réorganise les squelettes carbonés selon les besoins cellulaires.
Comparaison

Les deux phases de la voie des pentoses phosphates

CritèrePhase oxydativePhase non oxydative
Nature des réactionsoxydations et décarboxylationtransferts de fragments carbonés
Réversibilitéirréversibleréversible
Produit caractéristiqueNADPH\mathrm{NADPH}NADPHribose-5-phosphate ou intermédiaires glucidiques
Fonction principalepouvoir réducteuradaptation des squelettes carbonés

Les deux phases sont fonctionnellement associées, mais peuvent répondre à des besoins cellulaires différents.

Phase oxydative

Oxydation du glucose-6-phosphate

La première réaction est catalysée par la glucose-6-phosphate déshydrogénase, ou G6PD. Elle oxyde le glucose-6-phosphate en 6-phosphoglucono-δ\deltaδ-lactone. Simultanément, le nicotinamide adénine dinucléotide phosphate oxydé, noté NADP+\mathrm{NADP}^+NADP+, capte des électrons et devient du NADPH\mathrm{NADPH}NADPH.

Cette réaction est déterminante, car elle engage le glucose-6-phosphate dans la voie. Elle constitue également l'étape principale de régulation.

La lactone formée est ensuite hydrolysée en 6-phosphogluconate. Une seconde oxydation, catalysée par la 6-phosphogluconate déshydrogénase, produit un deuxième NADPH\mathrm{NADPH}NADPH. Elle s'accompagne d'une décarboxylation, c'est-à-dire de la perte d'un atome de carbone sous forme de dioxyde de carbone, et conduit au ribulose-5-phosphate.

Formule

Bilan de la phase oxydative

Glucose-6-phosphate+2 NADPX++HX2O→Ribulose-5-phosphate+2 NADPH+2 HX++COX2\ce{Glucose-6-phosphate + 2 NADP+ + H2O -> Ribulose-5-phosphate + 2 NADPH + 2 H+ + CO2}Glucose-6-phosphate+2NADPX++HX2​O​Ribulose-5-phosphate+2NADPH+2HX++COX2​
  • Glucose-6-phosphate\ce{Glucose-6-phosphate}Glucose-6-phosphate : hexose phosphorylé entrant dans la voie
  • NADPX+\ce{NADP+}NADPX+ : coenzyme oxydé accepteur d'électrons
  • HX2O\ce{H2O}HX2​O : eau consommée au cours du bilan
  • Ribulose-5-phosphate\ce{Ribulose-5-phosphate}Ribulose-5-phosphate : pentose phosphate produit
  • NADPH\ce{NADPH}NADPH : coenzyme réduit portant le pouvoir réducteur
  • HX+\ce{H+}HX+ : proton libéré
  • COX2\ce{CO2}COX2​ : dioxyde de carbone issu de la décarboxylation

Ainsi, pour chaque molécule de glucose-6-phosphate engagée, la phase oxydative forme deux molécules de NADPH, une molécule de ribulose-5-phosphate et une molécule de dioxyde de carbone.

Régulation de la G6PD

L'activité de la G6PD dépend principalement du rapport entre NADP+\mathrm{NADP}^+NADP+ et NADPH\mathrm{NADPH}NADPH :

  • une augmentation de la disponibilité en NADP+\mathrm{NADP}^+NADP+ stimule l'oxydation du glucose-6-phosphate ;
  • une accumulation de NADPH\mathrm{NADPH}NADPH inhibe la G6PD.

Cette régulation est cohérente avec la fonction de la voie. Lorsque le NADPH est consommé, il est réoxydé en NADP+\mathrm{NADP}^+NADP+. Le substrat oxydé redevient alors disponible pour la G6PD, ce qui accélère la production de nouveau NADPH.

À retenir

Principe de régulation

La consommation du NADPH\mathrm{NADPH}NADPH augmente la quantité de NADP+\mathrm{NADP}^+NADP+ et stimule la phase oxydative. La voie s'adapte donc directement au besoin cellulaire en pouvoir réducteur.

Phase non oxydative

Interconversion des pentoses

Le ribulose-5-phosphate formé pendant la phase oxydative peut subir deux transformations réversibles :

  • une isomérisation le convertit en ribose-5-phosphate ;
  • une épimérisation le convertit en xylulose-5-phosphate.
Définition

Isomérisation

Transformation réversible d'une molécule en une autre possédant la même formule brute, mais une organisation différente des atomes.

Définition

Épimérisation

Transformation réversible modifiant la configuration d'un seul carbone asymétrique d'un ose.

Le ribose-5-phosphate est nécessaire à la formation de la partie glucidique des nucléotides. Le xylulose-5-phosphate participe aux réactions de transfert de fragments carbonés.

Réarrangement des squelettes carbonés

La phase non oxydative utilise principalement deux enzymes.

Définition

Transcétolase

Enzyme transférant un fragment à deux atomes de carbone d'un ose phosphate vers un autre ose phosphate. Son activité nécessite le pyrophosphate de thiamine comme coenzyme.

Définition

Transaldolase

Enzyme transférant un fragment à trois atomes de carbone entre deux oses phosphates.

Une première transcétolase transfère deux carbones du xylulose-5-phosphate vers le ribose-5-phosphate. Elle forme du glycéraldéhyde-3-phosphate, à trois carbones, et du sédoheptulose-7-phosphate, à sept carbones.

La transaldolase transfère ensuite trois carbones du sédoheptulose-7-phosphate vers le glycéraldéhyde-3-phosphate. Elle produit du fructose-6-phosphate, à six carbones, et de l'érythrose-4-phosphate, à quatre carbones.

Enfin, une seconde réaction de transcétolase transfère deux carbones du xylulose-5-phosphate vers l'érythrose-4-phosphate. Elle forme un second fructose-6-phosphate et un second glycéraldéhyde-3-phosphate.

Formule

Bilan carboné de la phase non oxydative

3 Ribulose-5-phosphate⇌2 Fructose-6-phosphate+Glyceraldehyde-3-phosphate\ce{3 Ribulose-5-phosphate <=> 2 Fructose-6-phosphate + Glyceraldehyde-3-phosphate}3Ribulose-5-phosphate​2Fructose-6-phosphate+Glyceraldehyde-3-phosphate
  • Ribulose-5-phosphate\ce{Ribulose-5-phosphate}Ribulose-5-phosphate : pentose phosphate à cinq atomes de carbone
  • Fructose-6-phosphate\ce{Fructose-6-phosphate}Fructose-6-phosphate : hexose phosphate à six atomes de carbone
  • Glyceraldehyde-3-phosphate\ce{Glyceraldehyde-3-phosphate}Glyceraldehyde-3-phosphate : triose phosphate à trois atomes de carbone
  • la double flèche indique la réversibilité globale des réactions

Le bilan conserve les quinze atomes de carbone initiaux. Le fructose-6-phosphate et le glycéraldéhyde-3-phosphate rejoignent le métabolisme glucidique central, sans que la voie des pentoses phosphates constitue elle-même une voie de production directe d'ATP.

Attention

Phase non oxydative ne signifie pas phase réductrice

La phase non oxydative ne produit pas de NADPH\mathrm{NADPH}NADPH. Son nom indique seulement qu'elle ne comporte pas les oxydations caractéristiques de la première phase.

Adaptation aux besoins cellulaires

La réversibilité de la phase non oxydative permet plusieurs fonctionnements.

Besoin conjoint en NADPH et en ribose

Lorsque la cellule a besoin des deux produits, la phase oxydative fournit le NADPH et le ribulose-5-phosphate. Celui-ci est ensuite converti en ribose-5-phosphate pour la synthèse des nucléotides.

Besoin prédominant en ribose-5-phosphate

Lorsque le besoin en ribose dépasse celui en NADPH, les réactions non oxydatives peuvent fonctionner en sens inverse. Le fructose-6-phosphate et le glycéraldéhyde-3-phosphate sont alors réorganisés en pentoses phosphates, sans passage obligatoire par la phase oxydative et donc sans production concomitante de NADPH.

Besoin prédominant en NADPH

Lorsque la demande en pouvoir réducteur est élevée, la phase oxydative fonctionne activement. Les pentoses formés sont convertis par la phase non oxydative en fructose-6-phosphate et glycéraldéhyde-3-phosphate. Ces molécules retournent dans le métabolisme glucidique central et peuvent contribuer au renouvellement du glucose-6-phosphate. Le carbone est ainsi recyclé tandis que la production de NADPH se poursuit.

À retenir

Souplesse fonctionnelle

La phase oxydative produit le NADPH\mathrm{NADPH}NADPH, tandis que la réversibilité de la phase non oxydative permet de produire ou de consommer du ribose-5-phosphate selon les besoins cellulaires.

NADPH, biosynthèses et défense antioxydante

Biosynthèses réductrices

Une biosynthèse réductrice construit des molécules complexes en apportant des électrons aux intermédiaires réactionnels. Le NADPH fournit ces électrons. La voie des pentoses phosphates relie donc directement le métabolisme du glucose aux synthèses cellulaires nécessitant un environnement réducteur.

Le NADPH intervient également dans certains systèmes de détoxification et dans le maintien de protéines sous une forme chimique fonctionnelle.

Protection contre le stress oxydant

Définition

Stress oxydant

Déséquilibre dans lequel la production d'espèces chimiques oxydantes dépasse les capacités cellulaires de neutralisation et risque d'endommager les lipides, les protéines et les acides nucléiques.

Le glutathion réduit, noté GSH, neutralise les peroxydes grâce à la glutathion peroxydase. Il est alors transformé en glutathion oxydé, noté GSSG. Pour restaurer le GSH, la glutathion réductase utilise les électrons fournis par le NADPH.

La séquence fonctionnelle est donc la suivante :

  1. les peroxydes oxydent le GSH en GSSG ;
  2. le NADPH fournit les électrons nécessaires à la réduction du GSSG ;
  3. le GSH régénéré peut de nouveau participer à l'élimination des peroxydes.

La voie des pentoses phosphates protège ainsi la cellule indirectement : elle ne neutralise pas elle-même les espèces oxydantes, mais fournit le pouvoir réducteur indispensable aux systèmes antioxydants.

Attention

Ne pas confondre NADH et NADPH

Le NADH\mathrm{NADH}NADH est principalement associé à la production d'énergie par oxydation des nutriments. Le NADPH\mathrm{NADPH}NADPH est principalement utilisé dans les biosynthèses réductrices et la défense antioxydante.

Points clés
  • La voie des pentoses phosphates est une voie cytosolique qui ne produit pas directement d'ATP.
  • La phase oxydative est irréversible et fournit deux NADPH\mathrm{NADPH}NADPH par glucose-6-phosphate oxydé.
  • La phase non oxydative est réversible et interconvertit pentoses phosphates, fructose-6-phosphate et glycéraldéhyde-3-phosphate.
  • Le ribose-5-phosphate fournit le squelette glucidique nécessaire à la synthèse des nucléotides.
  • Le NADPH\mathrm{NADPH}NADPH alimente les biosynthèses réductrices et la régénération du glutathion réduit.
  • L'orientation de la voie dépend du rapport entre les besoins cellulaires en NADPH et en ribose-5-phosphate.

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    • 3.2Réarrangement des squelettes carbonés lock — section verrouillée
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    • 4.1Besoin conjoint en NADPH et en ribose lock — section verrouillée
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    • 4.3Besoin prédominant en NADPH lock — section verrouillée
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